در این بخشنامه آمده است: در اجرای بند ۳ ماده ۲۵۵ قانون مالیات‌های مستقیم، به پیوست نظر اکثریت اعضای شورای عالی مالیاتی موضوع صورتجلسه شماره ۲۰۱-۴۱ مورخ ۱۲/ ‌۱۲/ ‌۹۷‬ درخصوص حکم بند ب ماده ۵۲ قانون برنامه پنج ساله ششم توسعه کشور نسبت به مالیات ارزش افزوده خدمات حمل و نقل ریلی، جهت اطلاع و اجرا به شرح ذیل ابلاغ می‌شود: «با توجه به حکم بند ب ماده ۵۲ قانون برنامه پنج ساله ششم توسعه مبنی بر اینکه «مالیات بر ارزش افزوده خدمات حمل و نقل ریلی علاوه بر معافیت‌های مذکور در بند ۱۲ ماده ۱۲ قانون مالیات ارزش افزوده با نرخ صفر محاسبه خواهد شد» از آنجا که به موجب بند ۱۲ ماده ۱۲ قانون مالیات ارزش افزوده، خدمات حمل و نقل عمومی مسافری درون و برون شهری جاده‌ای، ریلی، هوایی و دریایی از پرداخت مالیات و عوارض موضوع قانون مالیات ارزش افزوده معاف است، بنابراین در اجرای حکم بند ب ماده ۵۲ قانون برنامه پنج ساله توسعه در طول اجرای برنامه مذکور علاوه بر معافیت خدمات حمل و نقل عمومی مسافری ریلی، مالیات و عوارض ارزش افزوده خدمات حمل و نقل ریلی بار با نرخ صفر محاسبه و به استناد ماده ۱۷ قانون مالیات ارزش افزوده، مالیات‌هایی که در موقع خرید کالا یا خدمت برای فعالیت‌های اقتصادی خود (به نسبت حمل و نقل ریلی بار) به استناد صورتحساب‌های صادره موضوع این قانون پرداخت کرده‌اند، با رعایت مقررات قابل استرداد است.»