وی گفت: یکی از مهم‌ترین کارکردهای مالیات ارزش افزوده این است که فعال اقتصادی را در حکم مامور وصول مالیات قرار می‌دهد که به‌نیابت از دولت، مالیات را از حلقه بعد دریافت و به حلقه قبل پرداخت و آنها را تهاتر می‌کند.  مسیحی افزود: در معاملات بخش خصوصی و دولت از آنجا که دولت عمدتا به‌عنوان مصرف‌کننده و فعال اقتصادی است، این تمکین ضعف به‌شمار می‌رود و به همین علت تمرکز بر این شده تا الزام بخش‌های دولتی بالا برود.  وی با بیان اینکه، شهرداری‌ها با توجه به قانون مالیات ارزش افزوده در این حوزه ذی‌نفع محسوب می‌شوند، گفت: ۱۸ هزار میلیارد تومان از محل قانون مذکور به شهرداری‌ها پرداخت شده است.  مسیحی با اشاره به اختلافات سازمان امور مالیاتی با برخی شهرداری‌ها در پرداخت مالیات و عوارض قانونی گفت: با توجه به اینکه شهرداری‌ها در بحث قانون مالیات ارزش افزوده ذی‌نفع به‌حساب می‌آیند و سالانه مبالغ قابل‌‌توجهی نیز از این محل دریافت می‌کنند، باید در این حوزه پیشگام باشند.  وی افزود: پیمانکاران به‌دفعات به سازمان امور مالیاتی مراجعه و از عدم پرداخت و اجرای توافقات توسط شهرداری‌ها گلایه می‌کنند.  مسیحی در پاسخ به سوالی درباره آخرین وضعیت بدهی شهرداری تهران به سازمان امور مالیاتی درخصوص واردات واگن‌های مترو گفت: علاقه‌مند نیستیم از اقدامات اجرایی درباره شهرداری‌ها استفاده کنیم. معاون مالیات ارزش افزوده همچنین گفت: سازمان مالیاتی، با توجه به قانون، امکان استفاده از اقدامات اجرایی درباره حساب‌های بانکی بدهکاران سازمان وجود دارد؛ اما ما علاقه‌مند نیستیم که درباره شهرداری‌ها که از ذی‌نفعان قانون مالیات ارزش افزوده هستند از برخوردهای این‌چنینی بهره بگیریم. وی تاکید کرد، تا این لحظه هیچ گونه مجوزی از سوی سازمان مالیاتی درخصوص بلامانع بودن ترخیص واگن‌ها بدون پرداخت مالیات ارزش افزوده صادر نشده است. معاون سازمان مالیاتی با انتقاد از معافیت‌های مالیاتی بیش از ۴۰ درصد اقتصاد کشور گفت: اثر این معافیت‌ها فقط در بخش مالیات نیست، بلکه شکاف سیاست‌گذاری غلط و بی‌رویه ایجاد می‌کند و به بخش مشمول مالیات هم فشار می‌آورد.