این اتفاق درحالی رخ می‌دهد که بسیاری از اهالی فوتبال عقیده دارند باقری کمک فنی چندانی به برانکو نمی‌دهد و حضورش بیشتر جنبه‌های روحی و انضباطی تیم را تقویت می‌کند. در چنین شرایطی اما باقری سعی می‌کند در مورد هیچ مساله مهمی به صراحت موضع نگیرد. چکیده مصاحبه‌ای که دیروز خبرگزاری تسنیم از او منتشر کرده شاید فقط در همین چهار کلمه خلاصه شود: «به من مربوط نیست!» بحث محسن مسلمان، اختلافش با برانکو و آینده‌اش در پرسپولیس یکی از مهم‌ترین دغدغه‌های این روزهای هواداران پرسپولیس است. باقری در این مورد می‌گوید: «من کاری به این مسائل ندارم. سرمربی تیم تصمیم‌گیرنده نهایی در مورد همه موارد است. اجازه دهید به هر تصمیمی که از سوی برانکو گرفته شده یا می‌شود احترام بگذاریم و تابع آن باشیم. از شما رسانه‌ها هم می‌خواهم اینقدر به این موضوع نپردازید. ماندن یا رفتن مسلمان به من و شما ارتباطی ندارد. او خودش در این مورد تصمیم‌گیرنده است. اگر واقعا محسن دوست داشته باشد در پرسپولیس بماند، می‌ماند. برانکو کاری به او ندارد. متاسفانه شما رسانه‌ها خیلی به این مساله دامن زده‌ و موضوع را بزرگ کرده‌اید.»

 باقری در مورد ادامه همکاری سایر بازیکنان فاقد قرارداد با پرسپولیس هم کم‌وبیش موضعی مشابه دارد: «من چه کاره‌ام که از بازیکن بخواهم بماند یا برود؟! من مسوول تمدید قرارداد بازیکنان نیستم. هرکس دوست داشته باشد بماند با افتخار می‌ماند و کجا برود بهتر از پرسپولیس. هرکس هم دوست ندارد، برود. آنهایی که قرارداد ندارند خودشان تصمیم می‌گیرند بمانند یا بروند. » درحالی‌که دستیاران کی‌روش معمولا بازتاب‌دهنده نظرات او هستند، کریم باقری به‌عنوان دستیار برانکو حتی در مورد لیست تیم ملی و زمان اعلام آن هم موضع خاصی نمی‌گیرد: «زمان اعلام لیست تیم ملی چه تاثیری در بازی ما می‌توانست داشته باشد؟ آنهایی که در لیست قرار گرفتند حتما حق‌شان بوده و نفراتی هم که نیستند کاری از دست‌شان برنمی‌آید و باید با این قضیه کنار بیایند. اینکه فرصت برای اعلام لیست نبود یا بود بحث دیگری است که من نمی‌خواهم به آن بپردازم. من کاری به نظر دیگران ندارم. آنچه مشخص است مربیان تیم ملی نفرات خود را از مدتی قبل انتخاب کرده بودند و منتظر نبودند از این دو بازی آخر بازیکنی انتخاب کنند. فکر هم نکنم بازیکنی بعد از اعلام لیست روحیه‌اش تضعیف شده باشد.»