گروه بین‌الملل‌- ‌سازمان ملل متحد اتهام اجرای سازمان یافته و هدفمند خشونت‌های قومی در جنوب قرقیزستان را بررسی می‌کند. در حالی‌که خشونت و درگیری قومی بین ساکنان قرقیز و ازبک در دست کم دو شهر عمده جنوب قرقیزستان همچنان ادامه دارد. روپرت کولویل، از سخنگویان سازمان ملل متحد، در مصاحبه با بی‌بی‌سی گفته است که براساس برخی شواهد، به نظر می‌رسد کشتار، سرکوب و تجاوز جنسی به شکلی سازمان‌یافته و برنامه‌ریزی شده، اقلیت قومی ازبک ساکن این مناطق را هدف قرار داده است.

با برقراری وضعیت فوق‌العاده و استقرار نیروهای دولتی در شهرهای اوش و جلال آباد و نواحی اطراف آنها، ساکنان ازبک این مناطق گفته‌اند که نظامیان قرقیز، که برای استقرار آرامش به منطقه اعزام شده‌اند، به سوی آنان تیراندازی می‌کنند. ساکنان جنوب قرقیزستان به خصوص منطقه جلال‌آباد به حمایت از قربان بیک باقی‌اف، رییس‌جمهوری سرنگون شده این کشور شهرت دارند اما باقی اف، که به بلاروس گریخته، دست داشتن در اغتشاشات اخیر را به شدت تکذیب کرده است.