رایزنی در خصوص تحولات افغانستان، بخش دیگری از گفت‌وگوی وزیر امور خارجه کشورمان با ژنرال باجوا را تشکیل داد که طی آن دکتر امیرعبداللهیان برقراری آرامش و امنیت در افغانستان را جز از طریق تشکیل دولتی فراگیر و متشکل از همه اقوام عملی میسر ندانست. ژنرال قمر جاوید باجوا فرمانده ارتش پاکستان نیز در این دیدار با ابلاغ سلام به مقامات عالیه کشورمان، همکاری‌‌های دو کشور را بر اساس همسایگی و برادری ذکر کرد و تروریسم را دشمن مشترک ایران و پاکستان دانست و با توجه به ضرورت ارتقای هرچه بیشتر امنیت مرزهای مشترک، فعال شدن کمیته مشترک امنیت مرزی فی‌‌مابین را مورد تاکید قرار داد. وی همچنین بر ضرورت همکاری‌‌های مشترک و نزدیک‌تر در مورد افغانستان، خصوصا در زمینه مبارزه با تروریسم تاکید کرد.