محمد خوانساری در نخستین همایش مدیران فناوری اطلاعات، امنیت فضای مجازی و مراکز آپای دانشگاه‌ها و موسسات آموزشی، پژوهش و فناوری، وضعیت تعاملات فی ما بین سازمان فناوری اطلاعات ایران با وزارت علوم و به ویژه دانشگاه‌ها را تبیین کرد. وی در این مراسم اظهار کرد: «از نظر ریالی نیز در سال گذشته در مجموع با مراکز آپا، ۱۴۵ میلیارد ریال قرارداد داشتیم که در سال ۱۴۰۲ این رقم به ۵۴۱ میلیارد ریال افزایش پیدا می‌کند. همچنین با توجه به تاکید مقام معظم رهبری مبنی بر حمایت از شرکت‌های دانش‌بنیان با پنج شرکت فعال در این حوزه قرارداد داشتیم که این تعداد به ۲۵ شرکت ارتقا خواهد یافت و به عبارتی تعامل با شرکت‌های دانش‌بنیان از اولویت‌های سازمان فناوری اطلاعات ایران است.»

وی با اعلام این مهم که در شش ماهه دوم سال گذشته، شاهد حجم بالایی از حملات به مراکز آموزش عالی کشور بودیم، افزود: «طبق آمار ۴۸ مرکز آموزش عالی کشور با آسیب امنیتی رو‌به‌رو بوده‌اند که در نهایت منجر به رخدادهای امنیتی شده است.» معاون وزیر ارتباطات در خصوص چشم‌انداز فعالیت‌های پیش روی این سازمان در حوزه امنیت گفت: «در حال حاضر تعدادی از شرکت‌های دارای مجوز، خدمات مورد نیاز این حوزه را در ۹ گرایش ارائه می‌کنند، اما درصددیم تا پایان سال اپراتورهایی در این بخش فعال شوند تا به صورت یکپارچه خدمات تعریف شده در ۹ گرایش را ارائه دهند.» خوانساری در خاتمه خواستار ارتقای جایگاه ساختاری فعالان فناوری اطلاعات در دستگاه‌ها و ارتقای مراکز فناوری اطلاعات با کمک موارد قانونی شد. گفتنی است در این همایش، از مدیریت فناوری اطلاعات دانشگاه صنعتی اصفهان به عنوان مرکز پیشتاز در اتصال به پنجره خدمات هوشمند دولت و مرکز برتر در حوزه امنیت و نفوذ در شبکه، تقدیر شد. همچنین مرکز آپای دانشگاه صنعتی اصفهان به عنوان مرکز برتر آپای کشور شناخته شد.