فدراسیون‌های وزنه‌برداری و شنا، شیرجه و واترپلو با انتقاد از کمبود اعتباراتشان برای اجرای برنامه‌هایشان، تفاهمنامه همکاری مشترک خود را برای بودجه سال ۸۶ با کمیته ملی المپیک امضا نکردند. ‌ با توجه به افزایش نیافتن اعتبار کمیته ملی المپیک و در پی آن کاهش اعتبار برخی فدراسیون‌های ورزشی و یا افزایش نیافتن اعتبارات آنها نسبت به سال ۸۵ این امر به مهم‌ترین دغدغه مسوولان کمیته المپیک و فدراسیون‌های المپیکی تبدیل شده است، به طوری که برخی از آنها اجرای برنامه‌هایشان و اعزام‌های برون‌مرزی‌ را با مانع مواجه می‌بینند.

در این راستا علی کفاشیان دبیرکل کمیته ملی المپیک گفت: ما نظر فدراسیون‌های ورزشی را قبول داریم و نسبت به کمبود اعتبارات برای کسب سهمیه المپیک ۲۰۰۸ پکن دغدغه جدی داریم، بودجه کمیته ملی المپیک ۱۷میلیارد تومان بود که از این میزان ۱۴میلیارد تومان به فدراسیون‌های ورزشی داده شد و از ۳میلیارد باقی‌ مانده، یک میلیارد و ۲۰۰ میلیون تومان به آکادمی ملی المپیک و یک میلیارد و ۸۰۰میلیون تومان به کمیته ملی المپیک اختصاص داده شد.