شرایطی که برای استقلال به‌وجود آمده باعث شده تا خیلی از طرفداران این تیم وزیر ورزش را در بحران استقلال مقصر بدانند و حتی به او اتهام طرفداری از پرسپولیس بزنند. موضوعی که واکنش مسعود سلطانی‌فر را در پی داشته و او در گفت‌وگو با پایگاه خبری وزارت ورزش و جوانان هواداری از یک رنگ خاص را رد کرده است: «همه‌ رویدادهای ورزشی را در حد زمانی که داشته باشم دنبال می‌کنم و اگر زمان تماشا نداشته باشم نیز، شب حتما از طریق اخبار نتایج را دنبال خواهم کرد. رنگ سفید تیم‌ملی فوتبال رنگ مورد علاقه من است، رنگ‌های دیگر خیلی برای من در جهت اینکه بگویم طرفدار تیم خاصی هستم، کاملا غیرقابل قبول است. هر دوباشگاه پرسپولیس و استقلال بنیاد فوتبال ما هستند البته همه باشگاه‌ها درحال حاضر وضعیت خوبی در لیگ دارند و مسابقات خوبی را انجام می‌دهند. بالاخره همیشه یک قطب سومی در کنار این دو تیم وجود داشته است، یک زمانی تیم پاس، سپاهان و... بودند که کمک می‌کردند به فوتبال ایران.» او در ادامه تاکید می‌کند هیچ گرایشی به دو تیم فوتبال پایتخت ندارد: «هر زمان که حال این دو باشگاه خوب باشد حال تیم‌ملی فوتبال خوب است.هیچ گرایشی به هیچ تیمی ندارم و وظیفه، مسوولیت و گرایشم این است که به هر دو تیم پرطرفدار کمک کنم چراکه کمک به رشد این دو تیم، کمک به رشد تیم‌ملی است و کمک به افتخارآفرینی در سطح فوتبال آسیا و جهان است. با توجه به اینکه این دو تیم بیشترین هوادار را در سطح کشور دارند، حل مسائل و مشکلات آنها برایم مهم است؛ به‌گونه‌ای که این دو تیم همیشه پیروزی‌های خوبی کسب کنند و باعث عزت و افتخار ما شوند. وظیفه من کمک به ارتقا و رشد هر دو تیم سرخابی است.»