علی مطهری در پاسخ به سوال کار گذاشتن دستگاه شنود در محل کارش گفت: «موبایل‌های همه نمایندگان مجلس شنود می‌شود.» به نوشته روزنامه اعتماد، مطهری اضافه کرد: «دفتر نمایندگان مجلس محل رفت و آمد بسیاری از سیاسیون است و در دفتر کار من نیز سیاسیونی زیادی رفت و آمد دارند.» مطهری در پاسخ به اینکه نظر شما درباره فتنه‌گران سال ۸۸ چیست، گفت: «این افراد متهم به برخی اقدامات در کشور هستند.» او اضافه کرد: «نظرم را درباره این افراد در روزهای اول هم گفتم که حصر خانگی زمان مشخصی دارد و در حد یک تا ۲۰ روز قابل قبول است.» نماینده مردم تهران ابراز کرد: «محبوس کردن این افراد در مدت سه سال بدون محاکمه، این مدت طولانی حصر شده باشند را نمی‌پسندم و آثار خوبی برای نظام ندارد.» مطهری ادامه داد: «یکی از این افراد حال خوبی ندارد و اگر از بین برود، برای نظام هزینه دارد و اگر لازم است این افراد محاکمه شوند.» مطهری با اشاره به اقداماتی که این افراد در عاشورا و روز دانشجو انجام دادند، گفت: «تصمیم حصر طولانی مدت برای این افراد تصمیم یک طرفه است.» او اضافه کرد: «من معتقدم این افراد آزاد شوند و محاکمه علنی برگزار شود تا حقایق روشن شود و اگر محکوم شوند به حکم قانون کسی اعتراضی ندارد.» این نماینده مجلس ادامه داد: «محاکمه آنها باید همزمان با محاکمه احمدی‌نژاد انجام شود و این موضوعی است که در یکی، دو ماه اول بحران نیز مطرح کردم این سه نفر باید همزمان محاکمه شوند و اگر این محاکمه در کشور انجام می‌شد کار به اینجا‌ها کشیده نمی‌شد.» وی برگزاری جشن ملی را از دیگر مواردی دانست که به بحران سال ۸۸ دامن زد. مطهری بیان کرد: «موسوی باید صبر می‌کرد و قانع نشد و حرف مراجع قانونی را قبول می‌کرد.»