در پی نامه نگاری رییس مجمع عمومی سازمان نظام پزشکی کشور با رییس‌جمهور، درباره عملکرد هیات‌های نظارت بر انتخابات نظام پزشکی و روند رسیدگی به صلاحیت‌های نامزدهای انتخابات هیات‌مدیره این سازمان، محمود احمدی‌نژاد خواستار اصلاح این روند و تجدیدنظر درباره افرادی شد که بدون دلیل قانونی رد صلاحیت شده‌اند. به گزارش پایگاه اطلاع‌رسانی ریاست‌جمهوری، احمدی‌نژاد درباره نامه رییس مجمع عمومی سازمان نظام پزشکی خطاب به وزیر کشور و سرپرست وزارت بهداشت دستوری صادر کرد و نوشت: «جناب آقای طریقت؛ جناب آقای نجار. مطلب صحیح است. باید طبق قانون عمل شود و نظرات شخصی و گروهی و خارج از چارچوب قانون دخالتی نداشته باشد. چنانچه روند اصلاح نشود و افرادی که بدون دلیل قانونی رد صلاحیت شده‌اند با تجدیدنظر احقاق حق نشوند، برگزاری انتخابات خلاف قانون و از نظر اینجانب باطل است.»

بر اساس این گزارش، دکتر بیژن گودرزی رییس مجمع عمومی سازمان نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران در نامه خود خطاب رییس‌جمهور آورده است: «به استحضار می‌رساند که چندی است که مقدمات برگزاری انتخابات نظام پزشکی در حال اجرا می‌باشد، عملکرد هیات‌های نظارت بر انتخابات نظام پزشکی شهرستان‌ها، تهران بزرگ و هیات نظارت مرکزی در روند رسیدگی به صلاحیت نامزدهای انتخابات هیات‌مدیره سوالات و ابهامات فراوانی را برای جامعه پزشکی فراهم آورده است. از آن جمله می‌توان به رد صلاحیت تعدادی از پزشکان اشاره کرد که در دوره‌های متوالی مورد اعتماد و وثوق جامعه پزشکی قرار گرفته‌اند و بارها به عنوان رییس هیات‌مدیره شهرستان‌ها، عضو شورای‌عالی و حتی رییس کل سازمان نظام پزشکی انتخاب شده‌اند. بسیاری از ردشدگان از جمله اساتید شاغل در دانشگاه‌های علوم پزشکی و سایر نهادهای دولتی بوده و دارای سوابق انقلابی و از خادمین شناخته شده نظام جمهوری اسلامی می‌باشند. براساس قانون تشکیل سازمان نظام پزشکی مصوب مجلس شورای اسلامی و آیین‌نامه‌های مربوطه مراجع پنج‌گانه مورد استعلام در مورد این گروه از نامزدها اعلام نظر کرده‌اند، در کمال تعجب با آنکه پاسخ استعلامات مزبور حاکی از حسن سابقه برخی از این افراد بوده است، معهذا مشخص نیست که هیات‌های نظارت بنا به کدام مستمسک قانونی ایشان را رد صلاحیت کرده‌اند. در حالی که دولت خدمتگزار از طریق تمهیدات مشروع و قانونی موجبات اعتماد مردم به نظام مقدس جمهوری اسلامی را فراهم می‌سازد، معلوم نیست که چرا با رد صلاحیت افراد شاخص و مورد وثوق جامعه پزشکی موجبات دلسردی و عدم اعتماد در این جامعه فرهیخته فراهم می‌آید.

مجمع عمومی نظام پزشکی جمهوری اسلامی به عنوان فراگیرترین مرجع منتخب جامعه پزشکی از مقام منیع ریاست جمهوری تقاضا می‌کند که با مرعی کردن کلیه اقدامات قانونی و ملحوظ ساختن تمامی مقدورات، نسبت به اصلاح روند رسیدگی به صلاحیت نامزدهای انتخابات نظام پزشکی و عملکرد هیات‌های نظارت مرکزی، تهران و شهرستان‌ها دستور عاجل صادر فرمایند.»