عارف؛ معاون اول پزشکیان
او در دولت دوم اصلاحات نیز سمت معاون اول رئیسجمهور ایران را تا سال ۱۳۸۴ برعهده داشت. درهمین حال محمدرضا عارف در واکنش به حکم معاون اولیاش در شبکه ایکس در پیامی نوشت: برای خدمت به مردم، به همراهی و کمک همه دوستداران ایران عزیز نیازمندم. به دنبال این حکم محمد مخبر، سرپرست سابق ریاستجمهوری در پیامی انتصاب دکتر محمدرضا عارف به سمت معاونت اول ریاستجمهوری را تبریک گفت. علی طیبنیا از اعضای ستاد انتخاباتی مسعود پزشکیان نیز در پی انتصاب محمدرضا عارف به عنوان معاون اول رئیسجمهوری دولت چهاردهم در ویدئویی اظهار کرد: ضمن تبریک به جناب آقای دکتر عارف بابت پذیرش مسوولیت معاون اولی جناب آقای دکتر پزشکیان، لازم میدانم این نکته را بگویم که من به دلایل شخصی در حال حاضر آمادگی پذیرش این مسوولیت را نداشتم، ولی از روز اول در کنار آقای پزشکیان بودم و تا روز آخر خواهم بود.
وی تاکید کرد: با تمام توانم در جهت موفقیت و پیروزی دولت ایشان تلاش خواهم کرد و معتقدم که عبور از این شرایط سخت تنها با همدلی و همراهی همه گروهها امکانپذیر خواهد شد. محمدجواد ظریف، رئیس شورای راهبری کابینه چهاردهم نیز ضمن تبریک به محمدرضا عارف، نوشت: بسیار خرسندم که دوست ۴۵ ساله و برادر بزرگوارم جناب آقای دکتر محمدرضا عارف، دانشمند برجسته و سیاستمدار پرتجربه، پاکدست و معتدل مسوولیت معاون اولی را پذیرفتهاند. امروز در حضور ریاست محترم جمهوری جلسه بسیار خوبی با دکتر عارف و دکتر طیبنیا و دوستان دیگر داشتیم و آخرین تصمیمات شورای راهبری و دیگر تحولات را بررسی کردیم. ضمن عرض تبریک، برای جناب دکتر عارف در این مسوولیت جدید توفیق هرچه بیشتر را خواهانم.»/ایرنا/فرارو/باشگاه خبرنگاران جوان/ایسنا