علی مطهری با ارسال نامه سرگشاده ای به محمود احمدی‌نژاد به نامه وی به وزیران دال بر مخالفت با تفکیک جنسیتی واکنش نشان داد. به گزارش خبرآنلاین، فرزند شهید مطهری به رییس‌جمهور نوشته است: اینکه حکم اسلام یعنی اولویت عدم اختلاط دختر و پسر را امری سطحی و غیرعالمانه نامیده‌اید، بسیار مایه تاسف است. این نماینده مجلس همچنین نوشته است: امروز که دانشگاه‌های دخترانه به اندازه کافی نداریم باید در حد امکان از اختلاط جلوگیری کنیم و تلاش‌هایی که وزیر محترم علوم و همکارانشان انجام می‌دهند در مسیر اسلامی کردن دانشگاه‌ها از نظر ظاهر و محتوا است، گرچه اینجانب به برخی از آنها گفتم سرانجام آقایان مشائی و احمدی‌نژاد تحمل نخواهند کرد و این طرح را نیز مانند قانون عفاف و حجاب معلق خواهند نمود و امروز این پیش‌بینی به حقیقت پیوست. اگر بنا است اختلاط آزاد باشد باید روابط جنسی هم مانند دنیای غرب آزاد باشد والا عوارض روحی و روانی در پی خواهد داشت.