احمد توکلی، رییس مرکز پژوهش‌های مجلس در یادداشتی که در سایت الف منتشر کرد، در واکنش به تعیین کابینه به عنوان خط قرمز رییس‌جمهور نوشت: رییس‌جمهور با توجه به استقلال قوا (اصل پنجاه‌وهفتم)، نه‌تنها نقشی در رسیدگی به تظلمات و رسیدگی به اتهامات و بازداشت‌ها ندارد، بلکه اگر دخالت کند، نقض صریح قانون اساسی کرده است، چه رسد به آنکه در این عرصه وظیفه‌ای قانونی داشته باشد. وی افزود: در واقع نه تنها خط قرمزی برای رسیدگی به اتهام رییس‌جمهور و وزرا و اعضای دیگر کابینه مانند معاون اول، معاون اجرایی و رییس دفتر رییس‌جمهور وجود ندارد، بلکه قانون اساسی قوه‌قضائیه؛ یعنی قاضی را بالاتر از این مقامات نشانده است.

نماینده تهران می‌افزاید: اگر [رییس‌جمهور] به نظرش رسید «مجموعه این حرکت‌ها، یک کار سیاسی است» که در تعقیب برخی «مطامع سیاسی» صورت می‌گیرد (‌چنانکه رییس‌جمهور گفته است)، باید طبق اصل پنجاه و هفتم که قوای سه‌گانه را «زیر نظر ولایت مطلقه امر و امامت امت» می‌شمارد، به رهبری مراجعه کند و طبق بند ۷ اصل یکصد و دهم از ایشان بخواهد که به حل اختلاف قوه‌مجریه و قوه‌قضائیه بپردازد. آن هم در امری به این مهمی که قوه‌قضائیه (به‌زعم رییس‌جمهور) در حال توطئه علیه اعضای کابینه است برای قدرت طلبی و اغراض سیاسی. نه آنکه تهدید کند به مردم روی خواهد آورد و «کارها و مسائل را با مردم» در میان خواهد گذارد. در حالی که تصریح می‌کند که این کار «حتما به کشور آسیب خواهد ‌زد.»