وی درمورد تصمیم حضورش در انتخابات ۱۴۰۰گفت: واقعیت این است که اصلا خودم بنای حضور نداشتم؛ برای اینکه احساس مسوولیت نمی‌کردم و معتقد بودم افراد زیادی برای تصدی این مسوولیت حضور دارند. این تصمیم پابرجا بود تا‌ اینکه با پیش‌بینی‌ها و ارزیابی‌های قابل‌توجهی مواجه شدیم. این را بگویم که بیش از اقبال افراد و جریانات خاص که به نوبه خود بسیار ارزشمند است، اقبال مردمی برای من مهم بود و از همین‌رو بود که ارزیابی‌ها برای من مهم بود. فرآیند شورای‌نگهبان هم خیلی برایم مهم نبود. اگر هم رد می‌کردند اتفاق مهمی نمی‌افتاد.  وی همچنین گفت: به‌نظرم، ما در برهه بسیار مهمی از کشور هستیم؛ نه از این باب که همیشه می‌گویند، «برهه حساس کنونی»! بلکه واقعیت این است که امروز وضع معیشت مردم در دوره بسیار سختی است. البته ما هنوز به فقر نسلی بر‌نخورده و به فقر فرهنگی هم نرسیده‌ایم، ولی اگر فقر اقتصادی تا‌ یکی دو نسل ادامه بیاید، کار ممکن است به فقر فرهنگی بکشد. سید‌حسن خمینی در ادامه گفت: واقعیت این است که جریان افراطی در کشور ما بعضا‌تصمیم‌های بسیار خطرناک ایدئولوژیک می‌گیرد. البته من معتقد نیستم همه این افراد ایدئولوژیک هستند، بلکه خیلی از آنها کاسب هستند، ولی به هر‌حال تصمیماتی با پایه‌های ایدئولوژیکی می‌گیرند که غلط و خطرناک است. وی تا‌کید کرد: به نظر من واقعا حکومت یکدست افراطی برای کشور خطرناک است. او در ادامه سخنانش گفت: اولین مساله این است که باید سعی کنید امید را به جامعه برگردانید. مردم خیلی ناامید و قهر هستند و حق هم دارند‌ چرا‌که در این سال‌ها روش‌های درستی در مواجهه با جامعه انجام نگرفت.