در متن حکم رئیس‌جمهوری خطاب به عبدالرضا رحمانی‌فضلی وزیر کشور آمده است: پیرو فرمایشات و توصیه‌های مقام معظم رهبری (مدظله العالی) در جلسه مورخ ۰۳/ ۰۸/ ۱۳۹۹ ستاد ملی مبارزه با کرونا مبنی بر تشکیل قرارگاه عملیاتی و لزوم مشارکت و همکاری حداکثری در کنترل، پیشگیری و درمان بیماران کرونایی و تقلیل میزان فراگیری این ویروس و استمرار آگاه‌سازی و ‌آموزش همگانی در نحوه مراقبت و مقابله با این بیماری، به موجب این حکم جناب‌عالی را به‌عنوان «فرمانده قرارگاه عملیاتی ستاد ملی مبارزه با کرونا» منصوب می‌کنم. رئیس‌جمهوری تصریح کرد: ضروری است اقدامات قرارگاه را با توجه به وظایف و اولویت‌های ذیل برنامه‌ریزی و اجرا کرده و نتایج آن مستمرا به اینجانب گزارش شود.

رئیس‌جمهوری همچنین در حکم جداگانه‌ای با انتصاب دکتر علیرضا رئیسی به‌عنوان «سخنگوی ستاد ملی مبارزه با ویروس کرونا» تاکید کرد که از این تاریخ، تنها مرجع موثق و قابل استناد در مورد اعلام برنامه‌ها و مصوبات ستاد ملی مبارزه با کرونا، سخنگوی ستاد خواهد بود.