مدیرمسوول روزنامه جمهوری اسلامی افزود: وقتی آیت‌الله یزدی رئیس جامعه مدرسین شدند گفتم آقا موقعیت خوبی فراهم است، حالا که شما رئیس شدید جامعه مدرسین را از حالت رکود خارج کنید، فعالش کنید و این دعواها را کنار بگذارید، سعه‌صدر نشان دهید تا همه زیر چتر جامعه مدرسین باشند، منتهی گوش نکردند.

مهاجری در پاسخ به سوالی درباره تلاش طیفی از تندروها برای ایجاد دوقطبی و دوگانه بین روحانیت در قم و تاثیر این موضوع بر بی‌اعتبار شدن جایگاه حوزه و روحانیت، گفت: این دوگانه‌سازی در دل روحانیت وجود دارد و بسیار خطرناک است. منشا آن هم، خود حق پنداری است. یک عده‌ای فکر می‌کنند که انقلاب هستند، انقلابی هستند، اسلام هستند، حق هستند. آنها می‌فهمند و دیگران نمی‌فهمند. این تفکرات خطرناک است، اساسا هیچ کسی نباید خودش را اسلام بپندارد.او با تاکید براینکه قم باید آزادترین مرکز گفت‌وگوها باشد، تاکید کرد: همه باید بنشینند و حرف بزنند. همان جلسه پنج‌شنبه که سخنرانی آقای واعظی را برهم زدند، آن آقا می‌توانست حرفش را بزند و بگوید من این حرف را دارم شما جوابی اگر داری بگو نه اینکه بگوید تو حرف نزن، تو لیاقت حرف زدن نداری. این طیف از افراد هرچه می‌خواهند می‌گویند و به طرف مقابل هم می‌گویند تو صحبت نکن. این رفتارها خطرناک است.مدیرمسوول روزنامه جمهوری‌اسلامی با بیان اینکه ما الان دچار چنین بیماری در قم هستیم، تاکید کرد: این بیماری باید در قم ریشه کن شود، قم باید به هویت اصلی خودش برگردد. همه آزادانه حرف خود را بزنند، همه تحمل کنند و اگر لازم شد رد هم بکنند.