متن پیام حضرت آیت‌الله خامنه‌ای به این شرح است:

بسم الله الرحمن الرحیم

درگذشت عالم جلیل جناب مستطاب حجت‌الاسلام والمسلمین آقای حاج شیخ مرتضی اشرفی شاهرودی رحمة‌الله‌علیه را به خاندان مکرم و بازماندگان معزّز به‌ویژه اخوی معظم ایشان و نیز به ارادتمندان و شاگردان آن مرحوم و به همه مردم مومن و انقلابی شاهرود تسلیت عرض می‌کنم و رحمت و مغفرت الهی و علو درجات ایشان را مسالت می‌نمایم.

اخبار مرتبط