دبیر شورای عالی فضای مجازی با اعلام خودداری این شورا از ورود در امور اجرایی، برنامه‌ریزی در امور راهبردی و طراحی برنامه‌های کلان و ملی و همکاری با دستگاه‌های اجرایی را از جمله اقدامات شورای عالی و مرکز ملی فضای مجازی دانست.
به گزارش پایگاه اطلاع‌رسانی دولت، محمدحسن انتظاری، دبیر شورای عالی و رییس مرکز ملی فضای مجازی، بخش مهمی از توسعه آینده کشور و یکی از راه‌حل‌های اصلی چالش‌های پیشِ‌رو را مرتبط با فضای مجازی دانست. وی در خصوص برنامه‌هایی که باید در مرکز ملی فضای مجازی در کشور دنبال شود، گفت: ساختار مرکز ملی فضای مجازی باید به‌گونه‌ای مورد بازنگری قرار گیرد که نسبت به پیاده کردن اهداف شورای عالی فضای مجازی رویکردی راهبردی داشته باشد.دبیر شورای عالی فضای مجازی با اشاره به برنامه‌های مرکز ملی فضای مجازی در خصوص ایجاد شبکه ملی اطلاعات در کشور افزود: این مرکز در واقع بحث هماهنگی و هدایت جریان‌های مرتبط را به‌عهده دارد و موضوع طراحی کلی شبکه در لایحه راهبردی را اجرا خواهد کرد. وی خاطرنشان کرد: اینکه چه خدماتی در این شبکه به شهروندان و دستگاه‌های مختلف ارائه شود و همچنین ارتباط اینها با شبکه جهانی چگونه باید باشد، مسائلی است که در مرکز ملی فضای مجازی با همکاری همه دستگاه‌ها تدوین می‌شود.
در همین راستا نیز اعضای شورای‌عالی فضای مجازی از دبیر جدید شورا خواستند که وارد مسائل اجرایی نشود. محمود واعظی، وزیر ارتباطات و فناوری اطلاعات، با اشاره به اینکه در اولین جلسه شورای‌عالی فضای مجازی در دولت یازدهم گزارشی از عملکرد ۴۰ روزه دبیرخانه در رابطه با فعالیت‌ها و برنامه‌ریزی‌ها و آنچه در کمیسیون‌های مختلف شکل گرفته بود ارائه شد، گفت: در این جلسه اعضای شورا خط مشی‌ مناسب برای مرکز ملی فضای مجازی را بررسی و از دبیر جدید شورا خواستند که وارد مسائل اجرایی نشده و همانطور که در حکم مقام معظم رهبری بر آن تاکید شده بر سیاست‌گذاری، هماهنگی و نظارت تمرکز و یک راهبرد کلان داشته باشد.