هیات وزیران با توجه به نظر رییس مجلس شورای اسلامی‌(موضوع نامه دهم خرداد ۸۹) اساسنامه بانک توسعه تعاون را اصلاح کرد. به گزارش ایسنا به نقل از پایگاه اطلاع‌رسانی دولت، بر اساس مصوبه دولت در خصوص اصلاح اساسنامه بانک توسعه تعاون، ۱۰ تغییر در اساسنامه بانک توسعه تعاون صورت گرفت که پس از تایید شورای نگهبان ابلاغ شد. طبق این مصوبه، ماده ۲ اصلاح اساسنامه بانک توسعه تعاون بدین‌گونه اصلاح شد: «بانک دارای شخصیت حقوقی و استقلال اداری و مالی است و به صورت شرکت دولتی در حمایت و اجرای برنامه‌های وزارت تعاون در تامین منابع سرمایه‌ای بخش تعاونی طبق مقررات این اساسنامه و قوانین پولی و بانکی کشور عمل نموده و مشمول نظارت بانک مرکزی است و در موارد پیش‌بینی نشده، طبق قوانین و مقررات مربوط اداره می‌شود.» همچنین بند ۳ ماده ۶ که درباره اهداف بانک توسعه تعاون است، بدین گونه اصلاح شد: «فراهم نمودن بستر مناسب برای توسعه مشارکت بخش تعاونی در فعالیت‌های اقتصادی.» در اساسنامه قبلی این بند، «فراهم نمودن بستر مناسب برای توسعه مشارکت بخش غیردولتی در فعالیت‌های اقتصادی با اولویت بخش تعاونی» بود. بند (۴) ماده (۶) نیز که قبلا «حمایت مالی و اعتباری از انتقال فعالیت‌ها و کاهش تصدی‌های بخش دولتی اقتصاد به بخش غیردولتی با اولویت دادن به تعاونی‌ها» بود به «حمایت مالی و اعتباری از انتقال فعالیت‌ها و کاهش تصدی‌های بخش دولتی اقتصاد به بخش تعاونی» اصلاح شد.

در ماده (۱۲) که درباره اختیارات و وظایف مجمع عمومی‌ عادی بانک توسعه تعاون است، نیز اصلاحاتی صورت گرفت و بند ۴ آن به «تصمیم‌گیری در خصوص آیین‌نامه‌های اعتباری، مالی، معاملاتی، اداری، استخدامی ‌و سایر آیین‌نامه‌های مورد نیاز بانک به پیشنهاد هیات مدیره و تصویب آن در هیات وزیران» تغییر یافت. دربند (۵) ماده (۱۲) هم با اصلاح صورت گرفته، انتخاب اعضای هیات مدیره و مدیرعامل بانک توسعه تعاون که طبق مصوبه پیشین بنا به پیشنهاد وزیر تعاون بود «بنا به پیشنهاد رییس مجمع» تغییر یافت. بند ۱۰ ماده ۱۲ نیز بدین شرح اصلاح شد: «تعیین حقوق و مزایای مدیر عامل و اعضای هیات مدیره و پاداش آنها و حق حضور اعضای غیر موظف هیات مدیره بر اساس پیشنهاد رییس مجمع با رعایت مصوبات شورای حقوق و دستمزد و ماده (۲۴۱) لایحه قانونی اصلاح قسمتی از قانون تجارت و سایر قوانین و مقررات مربوط جهت تصمیم‌گیری در مراجع ذی صلاح قانونی» بند ۲ ماده ۱۴ که درباره اختیارات و وظایف مجمع عمومی‌ فوق‌العاده بانک است نیز اصلاح شد و به «افزایش سرمایه بانک» تغییر یافت. در ماده ۱۵ نیز عبارت وزیر تعاون به عبارت رییس مجمع تغییر یافت و بر این اساس «هیات مدیره بانک متشکل از پنج نفر می‌باشد و انتخاب هیات مدیره و مدیرعامل توسط رییس مجمع به مجمع عمومی ‌پیشنهاد و پس از تصویب مجمع عمومی ‌با حکم وی منصوب می‌گردند.» بند ۵ ماده ۱۸ که درباره وظایف و اختیارات هیات مدیره است نیز اصلاح شد و به «بررسی طرح سازمانی، تشکیلات و شرح وظایف مشاغل بانک و تصویب آن در مراجع ذی صلاح قانونی» تغییر یافت. بند ۶ همین ماده هم به «تعیین سیاست‌های اعتباری بانک با رعایت ماده ۱۹ قانون عملیات بانکی بدون ربا

(بهره ) مصوب ۱۳۶۲» تغییر یافت. این اصلاحیه ۲۶ تیر ۸۹ از سوی معاون اول رییس‌جمهور ابلاغ شده است.