به گزارش مرکز اطلاع‌رسانی، روابط‌عمومی و امور بین‌الملل سازمان برنامه و بودجه کشور وی درباره اخبار برخی خبرگزاری‌ها پس از تقدیم لایحه بودجه سال ۹۹ از سوی رئیس‌جمهوری به مجلس شورای اسلامی مبنی بر کاهش ۸۰ درصدی بودجه فعالیت‌های قرآنی گفت: اعتبارات مندرج در ردیف «صندوق مشارکت توسعه فرهنگ قرآنی» تنها یکی از منابع اعتباری در نظر گرفته شده برای انجام فعالیت های قرآنی در دستگاه‌های اجرایی و سایر موسسات مرتبط با امور قرآنی است.  وی افزود: این در حالی است که هر سال بسیاری از دستگاه‌های اجرایی و نهادهای غیر‌دولتی، اعتباراتی را صرف توسعه و ترویج امور قرآنی می‌کنند که بخشی از آنها دارای عناوین مشخص در برنامه‌ها و فعالیت‌ها بوده و بخشی دیگر فاقد عنوان مشخص با موضوع مزبور بوده و به‌صورت مستتر در فعالیت‌های دستگاه های اجرایی در حال انجام است. جعفری‌نژاد در این زمینه به فعالیت‌های مرتبط با تدوین و تدریس کتاب‌های درسی قرآن، چاپ و انتشار کتب و نشریات در زمینه قرآن، برگزاری کلاس‌های آموزشی با موضوع قرآن و نظایر آنها اشاره و اظهار کرد: وظیفه «صندوق مشارکت توسعه فرهنگ قرآنی» طبق اساسنامه مصوب سال ۱۳۹۵ منحصر در جذب و سپس تخصیص منابع اعتباری و مالی به دستگاه‌های اجرایی و نهادهای عمومی و موسسات قرآنی مردمی برای اجرای برنامه‌های مصوب شورای توسعه فرهنگ قرآنی است و در لایحه پیشنهادی سال ۱۳۹۹به دلایلی همچون محدودیت منابع عمومی، لزوم توجه به پرداخت حقوق و مزایا و هزینه‌های اجتناب‌ناپذیر و اصلاح ساختار بودجه با کاهش روبه‌رو شده است، اما اعتبار دستگاه های اجرایی فعال در امور قرآنی افزایش داشته است. جعفری‌نژاد افزود: به‌عنوان نمونه می‌توان به رشد ۱۹ درصدی اعتبار برنامه‌های قرآنی دانشگاه علوم و معارف قرآنی، رشد ۱۳ درصدی اعتبار پرداخت شهریه دانشجویی به حافظان و قاریان قرآن سازمان امور اوقاف و امور خیریه، رشد ۹ درصدی اعتبار برنامه قرآنی وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی و رشد ۱۰ درصدی اعتبار برنامه قرآنی سازمان تبلیغات اسلامی اشاره کرد. رئیس امور فرهنگ، گردشگری و ورزش سازمان برنامه و بودجه کشور اضافه کرد: همچنین برای کمک به انجام فعالیت‌های قرآنی در کنار سایر فعالیت‌های فرهنگی و دینی، هر ساله در ضوابط اجرایی بودجه به دستگاه‌های اجرایی اجازه داده می‌شود تا برخی هزینه‌های مربوط به امور قرآنی دستگاه‌ها پرداخت شود. این مقام مسوول افزود: بر همین اساس، هزینه‌های مربوط به پایگاه‌های مقاومت بسیج و فعالیت‌های دینی، فرهنگی و ورزشی و نیز بهبود و ارتقای دانش و سلامت کارکنان و اجرای آیین‌نامه ترویج و توسعه فرهنگ نماز از محل اعتبارات هزینه‌ای مصوب پرداخت شده خزانه به نحوی که به انجام فعالیت‌های اصلی دستگاه خدشه‌ای وارد نشود، در قالب موافقت‌نامه با این سازمان پرداخت می‌شود. وی همچنین اظهار کرد: با توجه به اینکه بسیاری از فعالیت‌های قرآنی دارای مجوز از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی و سایر دستگاه‌های ذی‌ربط همچون جشنواره‌ها و مسابقات قرآنی، آموزش‌های قرآن و عترت، فعالیت‌های تبلیغی و ترویجی و پژوهشی قرآنی نیز به استناد بند ل اصلاحی ماده ۱۳۹ قانون مالیات‌های مستقیم مصوب ۱۳۹۴ در شمول مصادیق معافیت صفر مالیاتی قرار گرفته بودند، با حذف بند الحاقی به تبصره شش ماده واحده لایحه بودجه سال ۱۳۹۹ کل کشور، مشمولان فعالیت‌های فوق در حوزه قرآنی نیزهمچنان می‌توانند از تسهیلات تعیین شده بهره‌مند شوند.