هیات دولت به استانداری‌ها اجازه داد در ازای ارائه خدمات و اجازه استفاده از امکانات بازارچه‌های مشترک مرزی، درآمد اجاره‌بهای غرفه، اماکن و تاسیسات از قبیل انبار، باسکول و غیره در این بازارچه‌ها را وصول نمایند. هیات وزیران در جلسه مورخ ۱۹/۱/۱۳۸۶ بنا به پیشنهاد مشترک وزارتخانه‌های کشور و بازرگانی و سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی کشور و به استناد بند «الف» تبصره (۷) قانون بودجه سال ۱۳۸۶ کل کشور، آیین‌نامه اجرایی بند یاد شده تصویب شد.

استانداران نیز موظفند گزارش‌های مربوط به عملکرد درآمدها، هزینه‌ها و عملیات انجام شده از محل اعتبارات این آیین‌نامه را هر چهار ماه یکبار به وزارت کشور و سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی کشور ارائه نمایند.

همچنین بر اساس تصویب هیات وزیران،گمرکات کشور به سیستم‌های کنترل الکترونیکی و دستگاه‌های کنترل نامحسوس تجهیز می‌شوند.

هیات وزیران در جلسه مورخ۱۹/۱/۱۳۸۶ بنا به پیشنهاد سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی کشور و به استناد بند «هـ» تبصره (۱) قانون بودجه سال ۱۳۸۶ کل کشور، آیین‌نامه اجرایی بند یادشده را تصویب کرد.

براساس این مصوبه، گمرک ایران مجاز است اعتبار ردیف شماره ۵۰۳۷۴۷ منظور در قسمت چهارم قانون بودجه سال۱۳۸۶ کل کشور را براساس موافقتنامه‌های مبادله شده با سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی کشور در امور زیر هزینه کنند:

-توسعه امر آموزش و بالابردن دانش تخصصی کارکنان از طریق برگزاری دوره‌های آموزشی، کارگروه‌ها و کارگاه‌های آموزشی و نظایر آن.

-تامین مسکن کارکنان گمرک‌های واقع در مناطق محروم مرزی و سواحل جنوبی کشور از طریق خرید، تکمیل، مرمت و تجهیز منازل سازمانی گمرک و پرداخت حق مسکن به کارکنان فاقد منزل سازمانی.