پس از گذشت چند سال از شکل‌گیری سازمان نظام صنفی رایانه‌ای کشور، شورای مرکزی این سازمان تصمیم به ایجاد کمیسیون‌های تخصصی آن سازمان کرده است. شورای مرکزی سازمان نظام صنفی رایانه‌ای کشور در جلسه فروردین‌ماه خود ایجاد کمیسیون‌های تخصصی در راستای تحقق اهداف و اجرای وظایف محوله در آیین‌نامه تشکیل آن سازمان و به‌منظور ایجاد هسته مشاوره، کارشناسی و تصمیم‌ساز برای ارکان خود را مصوب کرده است. کمیسیون‌هایی که قرار است فعالیت خود را شروع کنند عبارتند از:

کمیسیون تدوین مقررات، آیین نامه‌ها و دستورالعمل‌ها و بررسی قوانین حوزه فاوا، مشاورین، امور بین‌الملل، کمیسیون ساماندهی و نظم بخشی بازار، آموزش و پژوهش، اطلاع‌رسانی. تا پیش از شکل‌گیری کمیسیون‌های کشوری، کمیسیون تخصصی استان‌ها فعالیت خود را آغاز کرده بودند.