اغلب کارخانه‌های صنایع غذایی در ایران به سیستم تصفیه‌خانه فاضلاب مجهز هستند و محیط زیست به طور پیوسته بر نحوه تولید آنها نظارت دارد.

دکتر محمد حسینی، مسوول هماهنگی فراکسیون صنایع غذایی مجلس شورای اسلامی، در گفت‌وگو با ایسنا، با بیان این مطلب گفت: این که بانک جهانی درباره صنایع غذایی ایران و میزان سهم آنها در آلودگی آب‌ها نظر می‌دهد، لزوما درست نیست و ما فعالان صنایع غذایی آن را نادرست می‌دانیم. او افزود:‌ اگر کارخانه‌ای در زمینه صنایع غذایی تصفیه‌خانه فاضلاب نداشته باشد، اصلا نمی‌تواند مجوز گرفته و به تولید اقدام کند. براساس این گزارش، چندی پیش بانک جهانی در گزارش خود اعلام کرد که صنایع غذایی و نوشیدنی بیشترین نقش را در آلودگی آب‌های ایران دارند. گزارش بانک جهانی از وضعیت آلودگی آب‌های جهان که با عنوان شاخص‌های توسعه جهان منتشر شد، نقش صنایع غذایی و نوشیدنی در آلوده کردن آب‌های ایران را ۸/۴۳درصد برآورد کرده است. براساس این گزارش، صنایع تولید فلزات اولیه با ۲/۱۷ و صنایع نساجی با ۵/۱۲درصد پس از صنایع غذایی و نوشیدنی بیشترین نقش را در آلودگی آب‌های ایران دارند. در این گزارش نقش صنایع مواد شیمیایی در آلوده کردن آب‌های ایران ۸/۱۰درصد، صنایع کاغذ و خمیر ۱/۷درصد، صنایع چوب ۸/۰درصد، صنایع سنگ و سرامیک و شیشه ۶/۰درصد و سایر صنایع ۲/۷درصد برآورد شده است.