سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی کشور از ادغام ۲ سازمان امور اداری و استخدامی کشور و سازمان برنامه و بودجه مطابق مصوبه ۱۶ اسفند ۱۳۷۸ شورای‌عالی اداری ایجاد شده بود که در سال ۱۳۸۶ این سازمان منحل و به معاونت برنامه‌ریزی و نظارت راهبردی رئیس‌جمهور تبدیل شد. تا اینکه با روی کار آمدن دولت یازدهم دوباره سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی در آبان۱۳۹۳ احیا شد. رئیس‌جمهور در ۲‌حکم جداگانه جمشید انصاری از نمایندگان اسبق مجلس را به سمت ریاست سازمان امور اداری و استخدامی کشور برگزید و در حکم دیگری، محمدباقر نوبخت، رئیس سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی را به‌عنوان رئیس سازمان برنامه و بودجه منصوب کرد. تغییر در ساختار برنامه و بودجه و امور اداری و استخدامی باعث تفکیک وظایف و اختیارات سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی سابق در امور اداری و استخدامی به سازمان جدید خواهد شد. برخی کارشناسان بر این باورند که تفکیک این دو سازمان باعث افزایش کارآیی سازمان امور استخدامی و همین‌طور سازمان برنامه بودجه خواهد شد. از طرف دیگر برخی از کارشناسان معتقدند که سازمان امور استخدامی در حد معاونت رئیس‌جمهوری گستردگی ندارد و این جداسازی باعث به وجود آمدن یک سازمان ناکارآمد دولتی خواهد شد که تنها به بزرگ شدن دولت منجر می‌شود. در پرونده امروز، باشگاه اقتصاددانان به بررسی تفکیک این دو نهاد و همین‌طور تبعات آن پرداخته است.