بنا بر اعلام مسوولان این وزارتخانه یکی از مسائل عمده پردیس انجام معاملات غیرقانونی است. بررسی‌‌ها حاکی است که افراد معاملات قولنامه‌‌ای و به یک‌چندم قیمت انجام می‌‌دهند که مشکلاتی را برای آنها در پی دارد. بنابراین مردم باید دقت داشته باشند و در معاملاتی که انجام می‌‌دهند حتما از شرکت عمران شهر جدید پردیس استعلام بگیرند؛ زیرا هم خود دچار مشکل می‌‌شوند و هم شرکت دچار مشکلاتی خواهد شد. گزارش‌ها حاکی است در پرونده‌هایی که در دست بررسی است بالای یک‌هزار هکتار اراضی در دست اقدام قضایی است. براساس اعلام وزارت راه وشهرسازی، فعالیت برخی بنگاه‌های املاکی بدون مجوز در پردیس و انجام معاملات خارج از چارچوب بخشی از مشکلات پردیس هستند. بنابراین مقرر شده است تا آژانس‌‌های املاک بدون مجوز شناسایی شوند و تحت پیگیرد قضایی قرار بگیرند؛ زیرا عموما چنین آژانس‌‌های املاکی هستند که به سوداگری و معاملات غیرقانونی در کشور دامن می‌‌زنند و مشکلاتی را برای مردم و دولت ایجاد می‌‌کنند. در این گزارش تاکید شده است به‌صورت مستمر جلسات مشترک برگزار خواهد شد و موضوع تا حصول نتیجه پیگیری می‌‌شود.