امیر قلعه‌نویی، سرمربی تیم استقلال از جواد نکونام و عملکرد این بازیکن به هیچ‌وجه رضایت ندارد، اما این موضوع را علنی و ظاهری اعلام نکرده و فقط به آن اشاره‌ای داشته است. به گزارش باشگاه خبرنگاران، امیر قلعه‌نویی سرمربی تیم استقلال، با شرایط خاص و امیدواری‌های بسیار زیاد با حضور نکونام در استقلال موافقت کرد اما این اتفاق رخ نداد و سرمربی تیم استقلال با شرایط متفاوتی روبه‌رو شده است؛ زیرا نکونام آن بازیکن آماده‌ای نیست که امیر قلعه‌نویی به آن احساس نیاز داشت و قصد داشت با حضور وی جای خالی تیموریان را پر کند. نکونام بسیار ناآماده و کند برای استقلال بازی می‌کند و از آن بازیکنی که استقلالی‌ها انتظارش را داشتند فاصله زیادی دارد.

در این خصوص امیر قلعه‌نویی صحبتی را انجام نمی‌دهد اما شنیده می‌شود که وی در گفت‌وگویی خصوصی با جواد نکونام از این بازیکن خواسته است تا شرایط را برای خود در ترکیب این تیم تغییر دهد، زیرا با این اوضاع به هیچ وجه نمی‌تواند در ترکیب استقلال به موفقیت برسد.