همچنین رئیس‌جمهوری در حکمی با قدردانی از زحمات و تلاش‌های بی‌دریغ دکتر رضا فرجی‌دانا در طول دوره مسوولیت وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، وی را به سمت مشاور رئیس‌جمهور در امور علمی و آموزشی منصوب کرد.

متن حکم دکتر حسن روحانی به این شرح است:

بسم‌الله الرحمن الرحیم

جناب آقای دکتر رضا فرجی‌دانا

توفیق همکاری با دانشمندی پرتلاش چون جنابعالی برای دولت تدبیر و امید فرصت ارزشمندی بود که بسیار علاقه‌مند بودم این همکاری همچنان ادامه می‌یافت. اینک، ضمن آرزوی توفیق برای ادامه خدمت به نظام مقدس جمهوری اسلامی، مراتب تقدیر و تشکر خود را از زحمات و تلاش‌های بی‌دریغ و ارزنده جنابعالی در طول دوره مسوولیت در وزارت علوم، تحقیقات و فناوری ابراز می‌دارم. امید است همچون گذشته با اتکا به ایمان، دانش و تجربیات ارزشمندتان همواره منشأ خدمات موثری برای کشور باشید و با عنایات الهی در جهت تحقق آرمان‌های انقلاب اسلامی و اهداف نظام مقدس جمهوری اسلامی ایران موفق باشید. بدین‌وسیله جنابعالی را به‌عنوان مشاور رئیس‌جمهور در امور علمی و آموزشی منصوب می‌نمایم تا همچنان در کنار دولت تدبیر و امید منشأ خدمات ذی‌قیمتی باشید.

حسن روحانی