اپل، آی‌فون SE را اولین بار در مارس ۲۰۱۶ عرضه کرد و مدل بعدی آن با ظرفیت افزایش یافته، سال ۲۰۱۷ معرفی شد. نسخه اولیه این مدل همراه با آی‌فون ۶ اس، همچنان تولید می‌شود؛ ولی در هر دو  مدل ذکر شده، خروجی هدفون وجود دارد. قابلیت منحصر به فرد SE، اندازه کوچک و مناسب آن است. این مدل آی‌فون صفحه نمایش ۴ اینچی دارد و بسیار خوش‌دست است. خروجی هدفون در آی‌فون ۷ حذف شده و اپل در مدل‌های بعدی نیز این قابلیت را نگنجاند. این شرکت فعلا در این‌باره اظهار نظر نکرده است. به نظر می‌رسید اپل برای بهبود قابلیت ضدآب بودن و کمبود فضا در آی‌فون ۷ به بعد این تصمیم را گرفته است اما حالا برای موبایلی مثل SE مشخص نیست چرا باید جک هدفون حذف شود.