سید حسین موسویان در پاسخ به ادعاهای شاهزاده سعودی در کنفرانس سیاست خارجی در برلین که توسط وزارت خارجه آلمان و بنیاد کوربر با حضور ۳۰۰ نفر و ۶۰ شخصیت خارجی و بین‌المللی برگزار شد، گفت: «عربستان در شرایطی ایران را متهم به دخالت در بحرین می‌کند که خود این کشور به بحرین لشکرکشی کرده و پاسخ معترضان را با گلوله می‌دهد.» به گزارش خبرگزاری تسنیم، ترکی‌الفیصل شاهزاده سعودی در جریان این نشست ادعا کرد: «ایران از ابتدای انقلاب در امور داخلی کشورهای عرب منطقه دخالت کرد و در بحرین به دنبال ایجاد شورش بود.» او مدعی شد:‌ «ایران جزایر امارات را اشغال کرده است، در سوریه حضور نظامی دارد و در مقابل خواست مردم سوریه ایستاده و از بشار اسد که تظاهرات مسالمت‌آمیز مردم را با گلوله جواب می‌دهد، حمایت می‌کند.» سید حسین موسویان، معاون سابق امنیت بین‌الملل و سیاست خارجی شورای عالی امنیت ملی در پاسخ به ادعاهای ترکی گفت: «شما مدعی شدید که ایران از ابتدای انقلاب در امور داخلی اعراب دخالت کرده است. ظاهرا فراموش کرده اید که در اولین ماه‌های انقلاب یک کشور عربی(عراق) به ایران تجاوز کرد و عربستان و سایر کشورهای حوزه خلیج فارس از صدام متجاوز حمایت کردند و بیش از ۱۰۰ میلیارد دلار کمک مالی کردند.» این عضو سابق تیم مذاکره‌کننده هسته‌ای تاکید کرد: ‌«شما چرا توافقنامه امنیتی را نقض کردید؟و در عین حال ایران را متهم می‌کنید.»

سید حسین موسویان در ادامه گفت: «سوریه یک دولت قانونی داشت و شما و همه دنیا با آن رابطه داشتند. اسد اشتباه کرد که با تظاهرات مسالمت‌آمیز مردم سوریه برخورد خشونت‌آمیز کرد، اما مردم بحرین که ۸۰ درصد شیعه هستند هم تظاهرات مسالمت‌آمیز کردند و با گلوله مواجه شدند و شما در مقابل مردم بحرین ایستادید و به آنجا لشکرکشی کردید و در عین حال ایران را متهم می‌کنید که در مقابل خواست مردم عربی ایستاده و دخالت می‌کند. به اختلاف پوچ امارات با ایران در مورد جزایر اشاره کردید که مربوط به قبل از انقلاب است، اما عربستان که بیش از ایران با همسایگان عرب خود اختلاف مرزی دارد. چرا یک کلمه در مورد اختلافات مرزی خودتان به همسایگانتان حرف نمی‌زنید.»

حسین موسویان سفیر سابق ایران در آلمان است و پیش‌تر در زمانی که حسن روحانی دبیر شورای عالی امنیت ملی بود معاون امنیت ملی و سیاست‌خارجی او بود. در زمانی که روحانی مسوولیت پرونده هسته‌ای را بر‌عهده داشت نفر دوم تیم مذاکره‌کننده هسته‌ای به شمار می‌رفت.